Die Leitlinien für die Arbeit der Gesamt-EUREGIO gibt das Gemeinsame Präsidium vor. Es besteht aus jeweils drei Vertretern der Präsidien der drei Arbeitsgemeinschaften und wird durch die Geschäftsstellen unterstützt. Ein Repräsentant aus einer der drei Arbeitsgemeinschaften wird zum Vorsitzenden des Gemeinsamen Präsidiums der EUREGIO EGRENSIS gewählt und fungiert als politischer Repräsentant der drei Arbeitsgemeinschaften. Der Vorsitz wechselt alle zwei Jahre und liegt derzeit auf der böhmischen Seite:
Der aktuelle Gemeinsame Präsident
Seit Dezember 2021 hat der Landrat von Tirschenreuth (Bayern), Roland Grillmeier, den Vorsitz im Gemeinsamen Präsidium für die kommenden zwei Jahre inne. Übernommen hat er das Amt von Patrik Pizinger, Bürgermeister der Stadt Chodov (Böhmen).